Hi. In the attachment I send the tests I've done. Yesterday I had to wait 20 minutes; now only 4 or 6. I will ask about the network. Pavan Balaji <[email protected]> escribió:

It is possible there’s something really slow on your network. Just to eliminate MPI_INIT as a possible cause, can you try a non-MPI program: maybe /bin/true or /bin/hostname?

% mpiexec -f fila5 -np 8 /bin/true

— Pavan

On Nov 28, 2013, at 8:10 AM, Bixente BODO GOMEZ <[email protected]> wrote:

...

Goods.

I'm testing a mpich cluster (3.0.4) with 7 nodes quad core, Ubuntu 12.04. The master has the home directory and the nodes get it by nfs. I have change RPCNFSDCOUN from 8 to 64.

The programs go fine with master and ONE of the other nodes, but when I start them with more nodes, MPI_Init (I think so) takes long time (~20 minutes). At these time in all nodes there is many network (read and write) and master's hard disk activity. For exemple:

mpiu@u105251:~$ date; mpirun -f fila5 -np 8 test/hello; date mié nov 27 15:17:29 CET 2013 Hola desde el procesador u105251. 0 de 8 Hola desde el procesador u105251. 1 de 8 Hola desde el procesador u105251. 2 de 8 Hola desde el procesador u105251. 3 de 8 Hola desde el procesador u103972. 4 de 8 Hola desde el procesador u103972. 5 de 8 Hola desde el procesador u103972. 6 de 8 Hola desde el procesador u103972. 7 de 8 mié nov 27 15:17:30 CET 2013 mpiu@u105251:~$ date; mpirun -f fila5 -np 16 test/hello; date mié nov 27 15:17:39 CET 2013 Hola desde el procesador u105251. 2 de 16 Hola desde el procesador u105251. 0 de 16 Hola desde el procesador u105251. 1 de 16 Hola desde el procesador u105251. 3 de 16 Hola desde el procesador u103972. 4 de 16 Hola desde el procesador u103950. 8 de 16 Hola desde el procesador u103976.12 de 16 Hola desde el procesador u103972. 5 de 16 Hola desde el procesador u103950. 9 de 16 Hola desde el procesador u103976.13 de 16 Hola desde el procesador u103972. 7 de 16 Hola desde el procesador u103950.10 de 16 Hola desde el procesador u103976.14 de 16 Hola desde el procesador u103972. 6 de 16 Hola desde el procesador u103950.11 de 16 Hola desde el procesador u103976.15 de 16 mié nov 27 15:36:18 CET 2013 mpiu@u105251:~$

When the programs start, i.e. since the first C instrucction, they run fine. For that I think that the problem is MPI_init

Anybody kowns why? Thank.

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-- Pavan Balaji http://www.mcs.anl.gov/~balaji

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