April 2011 - Mpich2-maint - mailman3.cels.anl.gov

compiling parallel programms with ifort
by mohamed ali 27 Apr '11

27 Apr '11

Dear there I have installed MPICH2-1.3.2p1 on ubuntu and the installation was ended and tested successfully, When i try to compile a parallel program with ifort, it gives me error. i use this command for compiling: ifort heat_mpi.f90 hi.out -o the errors that appear are as follows: /tmp/ifortYgvRCy.o: In function `MAIN__': heat_mpi.f90:(.text+0x1f8): undefined reference to `mpi_init_' heat_mpi.f90:(.text+0x214): undefined reference to `mpi_comm_rank_' heat_mpi.f90:(.text+0x230): undefined reference to `mpi_comm_size_' heat_mpi.f90:(.text+0x255): undefined reference to `mpi_wtime_' heat_mpi.f90:(.text+0x1166): undefined reference to `mpi_send_' heat_mpi.f90:(.text+0x11ce): undefined reference to `mpi_recv_' heat_mpi.f90:(.text+0x1236): undefined reference to `mpi_send_' heat_mpi.f90:(.text+0x1294): undefined reference to `mpi_recv_' heat_mpi.f90:(.text+0x149f): undefined reference to `mpi_wtime_' heat_mpi.f90:(.text+0x1590): undefined reference to `mpi_finalize_' /tmp/ifortYgvRCy.o: In function `update_': heat_mpi.f90:(.text+0x27f9): undefined reference to `mpi_send_' heat_mpi.f90:(.text+0x2858): undefined reference to `mpi_recv_' heat_mpi.f90:(.text+0x28b7): undefined reference to `mpi_send_' heat_mpi.f90:(.text+0x2911): undefined reference to `mpi_r i have included the mpif.h file in the same directory and i added the paths of mpich2/include and mpich2/lib to the PATH variable. should i change some thing in my command? or do some thing to define the mpich2 to ifort. I had the ifort installed befor mpich2. thanks, Ali.

1 0

Re: [mpich2-maint] multi-core processores
by Darius Buntinas 27 Apr '11

27 Apr '11

Basically, just specify four times as many processes as you have nodes, and mpiexec will start four processes per node. For more details on specifying nodes, and fine tuning processor placement, look at the hydra user guide: http://wiki.mcs.anl.gov/mpich2/index.php/Using_the_Hydra_Process_Manager -d On Apr 27, 2011, at 8:17 AM, Mohamed Ali Abd El Aziz Essa wrote: > Dear there > > We are here in the university of Valencia, Spain. have installed mpich2 with > intel fortran compiler. we'd like to make use of multi-core intel. how it can > be defined for the mpiexec that the processor have 4 cores and to make use of > theme. > > with my regards, > > Ali. > > Instituto de Ingenieria Energetia > Ciudad Plitecnica de Inovacion > Universidad Politecnica de Valencia > 8E edeficio, accesso F, 5ª planta > Camino de Vera s/n > 46022 Valencia > España > Tel.: +34 963 87 91 23 (ext 79123) > Fax: +34 963 87 91 26 > > _______________________________________________ > mpich2-maint mailing list > mpich2-maint(a)lists.mcs.anl.gov > https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/mpich2-maint

1 0

multi-core processores
by Mohamed Ali Abd El Aziz Essa 27 Apr '11

27 Apr '11

Dear there We are here in the university of Valencia, Spain. have installed mpich2 with intel fortran compiler. we'd like to make use of multi-core intel. how it can be defined for the mpiexec that the processor have 4 cores and to make use of theme. with my regards, Ali. Instituto de Ingenieria Energetia Ciudad Plitecnica de Inovacion Universidad Politecnica de Valencia 8E edeficio, accesso F, 5ï¿½ planta Camino de Vera s/n 46022 Valencia Espaï¿½a Tel.: +34 963 87 91 23 (ext 79123) Fax: +34 963 87 91 26

1 0

Professionnel : Economisez sur vos appels internationaux.
by MobileGlobePro par planette04 26 Apr '11

26 Apr '11

Si vous ne pouvez pas lire cet email, suivre ce lien (http://front.planette04.net/php/emailing/view_mail.php?CODE=69E3M8VN_201351…) Newsletter MobileGlobe MobileGlobe (http://track.effiliation.com/servlet/effi.redir?id_compteur=11635916&url=ht…) MobileGlobe dï¿½mo (http://track.effiliation.com/servlet/effi.redir?id_compteur=11635916&url=ht…) (http://track.effiliation.com/servlet/effi.redir?id_compteur=11635916&url=ht…) La solution mobile professionnelle pour ï¿½conomiser jusquï¿½ï¿½ 80% sur vos appels internationaux! (http://track.effiliation.com/servlet/effi.redir?id_compteur=11635916&url=ht…) Vos devis comparatifs GEOLOCALISATION (http://track.effiliation.com/servlet/effi.redir?id_compteur=11635916&url=ht…) Aucun frais de dï¿½part aucun engagement sans changer ses habitudes (http://track.effiliation.com/servlet/effi.redir?id_compteur=11635916&url=ht…) tester gratuitement MobileGlobe (http://track.effiliation.com/servlet/effi.redir?id_compteur=11635916&url=ht…) (http://track.effiliation.com/servlet/effi.redir?id_compteur=11635916&url=ht…) Ne plus recevoir d'informations de notre part: Ici (http://track.effiliation.com/servlet/effi.redir?id_compteur=11635916&url=) Vous recevez cette newsletter car vous ï¿½tes abonnï¿½ au programme VOTRE NOM. Si ce message vous a causï¿½ un quelconque dï¿½rangement, nous vous prions de nous en excuser. Si vous voulez vous désinscrire, suivre ce lien (http://front.planette04.net/php/emailing/u.php?CODE=69E3M8VN_201351&HASH=84…)

1 0

MPE2 1.3.0 - problems with mvapich 1.2rc1
by Mark Dixon 18 Apr '11

18 Apr '11

Hi, Thanks for making MPE2 :) This is something I've hit when building MPE2 1.3.0 against MVAPICH 1.2rc1, but I suspect it might be a generic problem with MPE2 and MPI-1. During the build I see the following non-fatal error (example is with GCC 4.1.2): **** Making src/wrappers .... make --no-print-directory build_lib_bin mpicc -I.. -I../include -I/scratch/issmcd/build/mpe2/1.3.0/mpe2-1.3.0/include -I../../.. -I../../../include -c log_mpi_util.c mpicc -I.. -I../include -I/scratch/issmcd/build/mpe2/1.3.0/mpe2-1.3.0/include -I../../.. -I../../../include -c log_mpi_core.c mpicc -I.. -I../include -I/scratch/issmcd/build/mpe2/1.3.0/mpe2-1.3.0/include -I../../.. -I../../../include -c trace_mpi_core.c make --no-print-directory /scratch/issmcd/build/mpe2/1.3.0/mpe2-1.3.0/lib/liblmpe.a ar cr /scratch/issmcd/build/mpe2/1.3.0/mpe2-1.3.0/lib/liblmpe.a log_mpi_util.o log_mpi_core.o ranlib /scratch/issmcd/build/mpe2/1.3.0/mpe2-1.3.0/lib/liblmpe.a make --no-print-directory /scratch/issmcd/build/mpe2/1.3.0/mpe2-1.3.0/lib/libtmpe.a ar cr /scratch/issmcd/build/mpe2/1.3.0/mpe2-1.3.0/lib/libtmpe.a trace_mpi_core.o ranlib /scratch/issmcd/build/mpe2/1.3.0/mpe2-1.3.0/lib/libtmpe.a mpif90 -c mpi_f2c_consts.f In file mpi_f2c_consts.f:15 call csub_mpi_in_place( MPI_IN_PLACE ) 1 Error: Symbol 'mpi_in_place' at (1) has no IMPLICIT type make[5]: *** [mpi_f2c_consts.o] Error 1 make[4]: *** [default] Error 2 make[3]: *** [build_lib_bin] Error 2 make[2]: *** [all] Error 2 The result is that libmpe_f2cmpi.a is not being built. When I use mpecc to build an MPI program, I get the link error: ld: cannot find -lmpe_f2cmpi Looking at a few MPI-1 implementations I still have kicking around, I see that MPI_IN_PLACE isn't defined in any of them. Is this an undocumented MPI-2 dependency? Thanks, Mark -- ----------------------------------------------------------------- Mark Dixon Email : m.c.dixon(a)leeds.ac.uk HPC/Grid Systems Support Tel (int): 35429 Information Systems Services Tel (ext): +44(0)113 343 5429 University of Leeds, LS2 9JT, UK -----------------------------------------------------------------

1 0

Some Problem when using Jumpshot and Solution Wanted
by 李敏 14 Apr '11

14 Apr '11

Dear Sir, I'am writing to reflect some problem when using the performance analysis tool Jumpshot of your Laboratory. Jumpshot has huge advantage over the other performance analysis tool in terms of visualizing huge trace file and has faster process speed. But when I opened a slog2 trace file of 64M, it can't load the file normally. It reported error messages as follows: Exception in thread "AWT-EventQueue-0" java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space at viewer.zoomable.ScaledSlider.setDefaultLabelTable(ScaledSlider.java:172) at viewer.zoomable.ScaledSlider.setMaxLabel(ScaledSlider.java:186) at viewer.zoomable.ScaledSlider.setMaxLabel(ScaledSlider.java:190) at viewer.zoomable.RowAdjustments.initSlidersAndTextFields(RowAdjustments.java:161) at viewer.timelines.TimelinePanel.init(TimelinePanel.java:393) at viewer.timelines.TimelineFrame.init(TimelineFrame.java:57) at viewer.first.LogFileOperations$1.finished(LogFileOperations.java:246) at viewer.common.SwingWorker$1.run(SwingWorker.java:103) at java.awt.event.InvocationEvent.dispatch(Unknown Source) at java.awt.EventQueue.dispatchEvent(Unknown Source) at java.awt.EventDispatchThread.pumpOneEventForFilters(Unknown Source) at java.awt.EventDispatchThread.pumpEventsForFilter(Unknown Source) at java.awt.EventDispatchThread.pumpEventsForHierarchy(Unknown Source) at java.awt.EventDispatchThread.pumpEvents(Unknown Source) at java.awt.EventDispatchThread.pumpEvents(Unknown Source) at java.awt.EventDispatchThread.run(Unknown Source) I thought the memory of JVM is not enough at first, so I set the prameter -Xmx4096m. But it didn't work either. So could you explain this problem for me and give the solution? I will appreciate a lot if you could spare a little time for my confusion. I'm looking forward to your reply. yours sincerely Sarah

1 0

V international conference "History Lessons. First and Second World Wars, history of Russia and the World in 19-21 centuries"
by Organizing committee 10 Apr '11

10 Apr '11

Советскому народу и советской армии – победителям во Второй мировой и Великой Отечественной войнах, посвящается эта Конференция V международная научно-практическая конференция "Уроки истории. Первая и Вторая мировые войны, история России и Мира 19-21 веков – фундаментальные и прикладные исследования" 23-24 июня 2011 г. Санкт-Петербург, Россия Сайт Конференции (Conference site in Russian and English): geohist.org. Уважаемые коллеги! Уважаемые господа! Сообщаем Вам, что 23-24 июня 2011 г. в Санкт-Петербурге будет проведена V Международная научно-практическая конференция "Уроки истории. Первая и Вторая мировые войны, история России и мира 19-21 веков – фундаментальные и прикладные исследования". Приглашаем Вас и ваших коллег принять участие в работе Конференции, в том числе и в составе Оргкомитета, и выступить с докладом. На пленарных и секционных заседаниях Конференции предлагается рассмотреть и обсудить следующие вопросы: 1. Исторический и геополитический анализ событий в России и в мире в 19 веке и в первой трети 20 века и их влияние на историю России и мира в 20-21 веках; 2. Исторический и геополитический анализ событий накануне Второй мировой войны (ВМВ) и Великой Отечественной войны (ВОВ): Анализ внутрисоюзных и международных событий накануне войны; Анализ процессов предвоенного государственного, промышленного, военного и сельскохозяйственного строительства; Проблемы подготовки промышленности и советской армии в предвоенные годы; Внутриполитическая и международная обстановка накануне ВМВ; Анализ технологии подготовки и провоцирования начала войн, на примере ВМВ; 3. Исторический и геополитический анализ событий периодов ВМВ и ВОВ; Военные и политические события на территориях СССР, Западной Европы, на море и на других театрах военных действий; Передислокация и перевод промышленных предприятий на производство военной продукции в период ведения боевых действий, режим мобилизационной экономики; Создание и функционирование партизанского движения, и его вклад в победу СССР над Германией. Методы антипартизанской (антитеррористической) борьбы фашистской Германии на оккупированных территориях; Внутрисоюзные и международные события в период и после завершения ВОВ и их геополитические последствия; Битва под Москвой, окружение немцев под Сталинградом, Курская дуга и другие победы советской армии. Их роль в победе во ВМВ над Германией и её союзниками; Блокада, голод, прорыв и ликвидация блокады Ленинграда; Атомная бомбардировка авиацией США японских городов Хиросимы и Нагасаки, их функциональное назначение. Создание НАТО в 1949 году и провоцирование Соединенными Штатами Америки начала “холодной войны”. Формирование в США идеологии мирового господства и нового миропорядка под прицелом сшатовских военных баз как продолжение глобальной политики нацистской Германии; Потери гражданских и военных лиц, подсчет экономического ущерба, нанесенного Германией и её союзниками Советскому Союзу и другим жертвам их агрессии; Патриотизм и героизм советского народа и Красной армии – основа победы СССР во Второй мировой войне над фашистской Германией и её союзниками; Вклад высокотехнологической промышленности, высокотехнологического оружия и высокого уровня фундаментальных и прикладных исследований в победу СССР во Второй мировой войне; Функциональное назначение Второй мировой войны – геополитический анализ; 4. Исторический и геополитический анализ процессов послевоенного устройства Мира: Послевоенные военно-политические доктрины США о превентивной атомной бомбардировке советских городов и развязывание глобальной “холодной войны"; Создание оккупационных военных баз США в Европе и Азии - строительство глобального фашизма, нацизма и однополярного мира; Анализ причинно-следственных связей, геополитических и международных аспектов создания ООН, НАТО и, как следствие, Варшавского договора (1955 год) и других международных организаций после Второй мировой войны; Ялтинское, Хельсинское и другие международные соглашения и договора послевоенного мироустройства и проблемы их выполнения; 5. Фальсификация истории и результатов Второй мировой войны – один из методов продолжения ведения холодной войны, управления историческими процессами и нового передела мира; 6. Внутрисоюзные и Международные события в 1985-2011 годах: Уничтожение СССР и нарушение мирового баланса сил; Проблемы и перспективы восстановления многополярного мира, как мира без войн и региональных военных конфликтов; Проблемы легитимности процессов приватизации и оценка нанесенного приватизацией экономического ущерба России и гражданам России; Война Грузии против Южной Осетии и Абхазии в августе 2008 года - продолжение реализации агрессии НАТО и Евросоюза по отношению к СНГ; Нацизм, фашизм, расизм и геноцид Западной цивилизации в 19-21 веках. Генезис и морфология, исторический, геополитический и юридический анализ; Разделение должностей Президента и Главнокомандующего как механизм профилактики фашизма и коллаборационизма руководителей высших органов власти, механизм демократизации и укрепления безопасности государства. Плюсы и минусы; Идеология победы, сохранение истории совместных побед – основа современной государственной политики России и других стран СНГ; Ускорение интеграции стран СНГ с учетом технологии широкомасштабной интеграции стран Евросоюза; Развитие СНГ и интеграционные процессы Содружества на основе строительства единой высокотехнологической инновационной промышленности, единых финансовой, таможенной и оборонной систем, единой и взаимно интегрированной системы образовательных и научных организаций; 7. Геополитический и исторический анализ революций и борьбы общества с властью за свои права в Египте, Тунисе, Ливии и в других странах Средиземноморья и мира в 2011 году и в предыдущие годы 20-21 веков. Фундаментальные и прикладные исследования. Такой расширенный подход к тематике Конференции позволяет провести комплексный научный анализ исторических и геополитических событий в 19-21 веках, исследовать их влияние на современность и на будущую историю мира. Материалы Конференции будут опубликованы в рецензируемом Сборнике статей Конференции. Конференция предполагает две формы участия: очное и заочное, с публикацией материалов в Сборнике статей Конференции. Более подробную информацию о сроках регистрации и предоставлении докладов и статей на Конференцию, координаты для связи Вы сможете найти на сайте geohist.org. С уважением, Оргкомитет Конференции P.S. Для сведения: Работы, опубликованные в материалах международных и общероссийских конференций, зачитываются ВАК РФ при защите диссертаций. P.S. Если Вы не хотите больше получать информацию о Конференции, можно отписаться здесь.

1 0

V international conference "History Lessons. First and Second World Wars, history of Russia and the World in 19-21 centuries"
by Organizing committee 10 Apr '11

10 Apr '11

Советскому народу и советской армии – победителям во Второй мировой и Великой Отечественной войнах, посвящается эта Конференция V международная научно-практическая конференция "Уроки истории. Первая и Вторая мировые войны, история России и Мира 19-21 веков – фундаментальные и прикладные исследования" 23-24 июня 2011 г. Санкт-Петербург, Россия Сайт Конференции (Conference site in Russian and English): geohist.org. Уважаемые коллеги! Уважаемые господа! Сообщаем Вам, что 23-24 июня 2011 г. в Санкт-Петербурге будет проведена V Международная научно-практическая конференция "Уроки истории. Первая и Вторая мировые войны, история России и мира 19-21 веков – фундаментальные и прикладные исследования". Приглашаем Вас и ваших коллег принять участие в работе Конференции, в том числе и в составе Оргкомитета, и выступить с докладом. На пленарных и секционных заседаниях Конференции предлагается рассмотреть и обсудить следующие вопросы: 1. Исторический и геополитический анализ событий в России и в мире в 19 веке и в первой трети 20 века и их влияние на историю России и мира в 20-21 веках; 2. Исторический и геополитический анализ событий накануне Второй мировой войны (ВМВ) и Великой Отечественной войны (ВОВ): Анализ внутрисоюзных и международных событий накануне войны; Анализ процессов предвоенного государственного, промышленного, военного и сельскохозяйственного строительства; Проблемы подготовки промышленности и советской армии в предвоенные годы; Внутриполитическая и международная обстановка накануне ВМВ; Анализ технологии подготовки и провоцирования начала войн, на примере ВМВ; 3. Исторический и геополитический анализ событий периодов ВМВ и ВОВ; Военные и политические события на территориях СССР, Западной Европы, на море и на других театрах военных действий; Передислокация и перевод промышленных предприятий на производство военной продукции в период ведения боевых действий, режим мобилизационной экономики; Создание и функционирование партизанского движения, и его вклад в победу СССР над Германией. Методы антипартизанской (антитеррористической) борьбы фашистской Германии на оккупированных территориях; Внутрисоюзные и международные события в период и после завершения ВОВ и их геополитические последствия; Битва под Москвой, окружение немцев под Сталинградом, Курская дуга и другие победы советской армии. Их роль в победе во ВМВ над Германией и её союзниками; Блокада, голод, прорыв и ликвидация блокады Ленинграда; Атомная бомбардировка авиацией США японских городов Хиросимы и Нагасаки, их функциональное назначение. Создание НАТО в 1949 году и провоцирование Соединенными Штатами Америки начала “холодной войны”. Формирование в США идеологии мирового господства и нового миропорядка под прицелом сшатовских военных баз как продолжение глобальной политики нацистской Германии; Потери гражданских и военных лиц, подсчет экономического ущерба, нанесенного Германией и её союзниками Советскому Союзу и другим жертвам их агрессии; Патриотизм и героизм советского народа и Красной армии – основа победы СССР во Второй мировой войне над фашистской Германией и её союзниками; Вклад высокотехнологической промышленности, высокотехнологического оружия и высокого уровня фундаментальных и прикладных исследований в победу СССР во Второй мировой войне; Функциональное назначение Второй мировой войны – геополитический анализ; 4. Исторический и геополитический анализ процессов послевоенного устройства Мира: Послевоенные военно-политические доктрины США о превентивной атомной бомбардировке советских городов и развязывание глобальной “холодной войны"; Создание оккупационных военных баз США в Европе и Азии - строительство глобального фашизма, нацизма и однополярного мира; Анализ причинно-следственных связей, геополитических и международных аспектов создания ООН, НАТО и, как следствие, Варшавского договора (1955 год) и других международных организаций после Второй мировой войны; Ялтинское, Хельсинское и другие международные соглашения и договора послевоенного мироустройства и проблемы их выполнения; 5. Фальсификация истории и результатов Второй мировой войны – один из методов продолжения ведения холодной войны, управления историческими процессами и нового передела мира; 6. Внутрисоюзные и Международные события в 1985-2011 годах: Уничтожение СССР и нарушение мирового баланса сил; Проблемы и перспективы восстановления многополярного мира, как мира без войн и региональных военных конфликтов; Проблемы легитимности процессов приватизации и оценка нанесенного приватизацией экономического ущерба России и гражданам России; Война Грузии против Южной Осетии и Абхазии в августе 2008 года - продолжение реализации агрессии НАТО и Евросоюза по отношению к СНГ; Нацизм, фашизм, расизм и геноцид Западной цивилизации в 19-21 веках. Генезис и морфология, исторический, геополитический и юридический анализ; Разделение должностей Президента и Главнокомандующего как механизм профилактики фашизма и коллаборационизма руководителей высших органов власти, механизм демократизации и укрепления безопасности государства. Плюсы и минусы; Идеология победы, сохранение истории совместных побед – основа современной государственной политики России и других стран СНГ; Ускорение интеграции стран СНГ с учетом технологии широкомасштабной интеграции стран Евросоюза; Развитие СНГ и интеграционные процессы Содружества на основе строительства единой высокотехнологической инновационной промышленности, единых финансовой, таможенной и оборонной систем, единой и взаимно интегрированной системы образовательных и научных организаций; 7. Геополитический и исторический анализ революций и борьбы общества с властью за свои права в Египте, Тунисе, Ливии и в других странах Средиземноморья и мира в 2011 году и в предыдущие годы 20-21 веков. Фундаментальные и прикладные исследования. Такой расширенный подход к тематике Конференции позволяет провести комплексный научный анализ исторических и геополитических событий в 19-21 веках, исследовать их влияние на современность и на будущую историю мира. Материалы Конференции будут опубликованы в рецензируемом Сборнике статей Конференции. Конференция предполагает две формы участия: очное и заочное, с публикацией материалов в Сборнике статей Конференции. Более подробную информацию о сроках регистрации и предоставлении докладов и статей на Конференцию, координаты для связи Вы сможете найти на сайте geohist.org. С уважением, Оргкомитет Конференции P.S. Для сведения: Работы, опубликованные в материалах международных и общероссийских конференций, зачитываются ВАК РФ при защите диссертаций. P.S. Если Вы не хотите больше получать информацию о Конференции, можно отписаться здесь.

1 0

Varekai Presented by Manila Hotel
by GlobalLink MP Events International Inc. 08 Apr '11

08 Apr '11

1 0

Re: [mpich2-maint] Mpich installation
by Anthony Chan 06 Apr '11

06 Apr '11

Your config.log indicates that F77=fl32 was chosen but fl32 does not seem to understand -o. Since you are using cygwin, I suggest setting F77=gfortran and FC=gfortran as part of configure command if you need Fortran support. If you don't need Fortran support, add --disable-f77 and --disable-fc instead. Also, please use the latest stable release, 1.3.2p1. If you really want to use Windows specific compiler, the preview release 1.4rc1 should have better support. A.Chan ----- Original Message ----- > Hello, I am Munetake Nishihara at Ohio State University. > > I am currently trying to install mpich2-1.3, on cygwin installed on > vista (win 32, dual core). I think that configure procedure went well > (config.log), but it seems that I am having trouble in "make (m.txt)" > and "make install (mi.txt)." If you do not mind, could you give me > some advice? > > Thank you for your time, > > Munetake > _______________________________________________ > mpich2-maint mailing list > mpich2-maint(a)lists.mcs.anl.gov > https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/mpich2-maint

1 0